湿地作为一种长期存在、有着丰富水资源的自然生态系统，往往与区域地下水含水层有直接水文联系，当湿地水位低于周围陆地潜水面时，就会产生地下水入流，如果湿地的水位高于周围潜水面，地下水就会流出湿地。沼泽湿地补给地下的方式有直接补给和间接补给。直接补给是水分通过沼泽土壤直接渗透进入含水层；间接补给是指水分首先水平运动通过土壤进入位于可渗透性的土壤或河流，然后通过河流基底补给地下水。湿地中同时存在地下水入流和地下水出流，这类湿地可接受地下水，并能将过剩水输出到外界；有些湿地只接受地下水补给；如果湿地的地表水 ( 地下水 ) 水位高于该地区地下水位，湿地补给地下水（图1）。处于不同地貌部位的湿地，对地表水和地下水的影响也不同。
a,b 地下水补给湿地，又将剩余水排出
c,d 地下水补给湿地
e,f 湿地补给地下水